Довідково-пошуковий апарат (ДПА) ОНМБ складається з каталогів:

ДПА відображає наявний книжковий і журнальний фонд з 1950 р. по даний час. Загальне наповнення каталогів складає близько по 1,5 млн. джерел інформації: книг, збірників, періодичних видань, законодавчих нормативних актів.

Наймолодший у системі ОНМБ електронний каталог. Він формується в автоматизованій бібліотечній системі ІРБІС. Його 6 баз даних розкривають джерела інформації з 2002 року: "Книги ЖОНМБ", "Періодичні видання ЖОНМБ", "Список періодичних видань Державної наукової медичної бібліотеки" (Київ), "Автореферати Національної бібліотеки України ім. Вернадського" (НБУВ), "Накази МОЗ України" тощо. В базах даних 40 тис. описів джерел медичної наукової інформації.

В системі ДПА бібліотеки чільне місце займають тематичні картотеки з краєзнавства: "Охорона здоров'я Житомирщини" (1917), "Наукові праці лікарів Житомирської області" з 1950р., "Видання ЖОНМБ" та ін.

Про ДПА з краєзнавства детальніше див. сторінку "Краєзнавча робота".